福州海关还凸起对台特色，办事闽台合作大局，推出多项闽台合作支撑办法。在福州海关2015年推出的支撑自贸试验区72项办法中，支撑闽台经贸合作的有16项，被评为全国初创的10项办法中支撑闽台经贸合作的就占了7项，别离是“先验放，后报关”“闽台海运快件”“简化CEPA及ECFA原产地证书提交需求”“放宽间接运输鉴定尺度”“台车入闽一体化快速通关模式”“成立对台原产地证书核查机制”“两岸海上客运航路‘客带货’”。
福州海关先后出台支撑平潭分析尝试区扶植成长的22项办法，支撑平潭开展跨境电子商务试点，鞭策“台车入闽”快速通关、“客带货”营业有序推进；出台支撑中国-东盟海产物买卖所成长的9项办法，实现“关所共管”机制；出台支撑江阴整车进口快速通关的5项办法，通过RFID手艺、当场报关审价、预定检验等方式实现整车通关的无纸化、可视化、便利化，截至客岁12月31日，江阴整车港口进口汽车3878辆，同比增加79%；在马尾、福州保税区、三明海关启动旅游购物商品试点；启动长乐、平潭购物离境退税试点；开展福州片区首票保税展现买卖营业；推进利嘉集团等重点企业项目落地，推进福建自贸试验区新兴商业业态成长。
自福建自贸试验区挂牌以来，截至客岁12月31日，福州海关已出台支撑自贸试验区扶植办法72项，此中30项为福州海关自创。“简化CEPA及ECFA原产地证书提交需求”“协会总”“整车进口一体化快速通关”等10项办法更是全国初创。涉及原产地办理的2项立异办法，是全国第二批自贸试验区中率先经海关总署核准，在上海、天津、广东三个自贸试验区复制推广的。
福建自贸试验区福州片区和平潭片区自挂牌以来，截至客岁12月31日，新增海关心册企业1011家，增加1.6倍。
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昨日，福州某公司向福州海关现场营业处申请加工商业单耗信赖审核，仅5分钟就办结了审核手续，比本来的3至5日审核时间大大缩短，确保了企业出口的及时性。这是福州海关最 新推出的自贸区立异行动，自1月4日施行以来，福州海关关区的6家自贸区内联网监管高级认证企业已开展试点，共打点信赖审核31单。
